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足利義昭なんですが、１５９０年前後まで征夷大将軍です。この人は、権大納言、左中将、征夷大将軍なんです。織田信長は右大将なので、義昭より官位が上なんです。で、右大将任官は、足利義昭が征夷大将軍を辞任していないので、将軍より上の官位が必要だったんです。ちなみに、征夷大将軍は４位相当職、権大納言は３位相当職、右大将は２位相当職なので右大将は将軍より官位が上です。さらに源頼朝は征夷大将軍と右大将に任官しているんですね。征夷大将軍がなぜ武家の筆頭かは謎なんです。位的にはかなり低いので、大臣や大将と兼任するんですよ。
で、足利義昭が秀吉を養子にしなかったのは、恐らくは本人が将軍職を辞任する気がなかったからでしょう。
三官問題、信長の太上大臣か征夷大将軍任官要請ですが、現在は、本能寺の変の直前に、太上大臣ポストを受けたと考える説が有力になっているので朝廷との確執説は弱いと思います。あと、義昭は最後は準皇族になって秀吉と仲良く暮らしたみたいです。
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